Continuación de la guía de la primera temporada de Los Expedientes Secretos X.
- 1:11 - Fire: Mulder se reencuentra con una antigua novia mientras investigan a un pirómano capaz de provocar incendios de forma anómala.
- 1:12 - Beyond the Sea: tras la muerte de su padre, Scully enfrenta un caso ligado a un preso que parece tener información imposible de conocer.
- 1:13 - Genderbender: una comunidad religiosa aislada esconde una presencia capaz de cambiar de sexo y seducir a sus víctimas.
- 1:14 - Lazarus: un criminal parece apropiarse del cuerpo de un agente del FBI después de una experiencia cercana a la muerte.
- 1:15 - Young at Heart: un viejo enemigo de Mulder regresa con una identidad nueva y ansias de venganza.
- 1:16 - E.B.E.: Mulder investiga el traslado secreto de una supuesta entidad biológica extraterrestre.
- 1:17 - Miracle Man: un joven sanador religioso queda vinculado a varias muertes inexplicables.
- 1:18 - Shapes: en una reserva indígena los agentes se enfrentan a una leyenda de hombre lobo.
- 1:19 - Darkness Falls: insectos luminosos ocultos en el bosque atacan cuando cae la noche.
- 1:20 - Tooms: Eugene Tooms regresa para completar su ciclo alimentándose una vez más.
- 1:21 - Born Again: una niña parece canalizar la venganza de un policía asesinado.
- 1:22 - Roland: un hombre con discapacidad mental queda ligado a varios asesinatos de científicos.
- 1:23 - The Erlenmeyer Flask: Mulder y Scully descubren experimentos con híbridos humano-extraterrestres. Garganta Profunda muere y los Expedientes X son cerrados.
